重庆市科学技术研究院（简称 市科研院 / 重科院 ）系2008年由市政府整合原属中央和地方的10个研究院所组建而成的正厅局级事业单位，是集研究开发、中试孵化、成果转化和创新服务为一体的综合性科研机构和地方科学院，是全国省级地方科学院联盟的发起单位和全国科学院联盟的重要成员。现设有党建工作处（督查室、院工会）、办公室、干部人事处（人才办）、重科智谷建营办公室、规划发展处（研究室、改革办）、科研管理处（合作办）、资产财务处、纪检监察室等8个内设处室，技术评估、信息与自动化、新材料、低碳环保、生物医药、科技战略研究、大数据研究等7个研究中心（院），科技检测中心、科学咨询杂志社等2家事业单位，高技术创业、自动化仪表、机电设计、光学机械、硅酸盐、日用化工、理化计量、生物技术等8个转（改）制院所，组建市应用技术公司负责转（改）制院所公司和其它65家参控股企业的指导管理。院一期、二期（重科智谷）科技企业孵化器面积近20万平方米，拥有资产总额21亿元以上，已孵化莱美药业、赛丰基业、安碧捷等一批上市企业，现在孵企业300多家。
市科研院致力把技术研发和科技成果转移转化作为核心定位，累计牵头承担市级以上科研项目1800余项（其中国家级项目80余项），争取国家和地方财政科技投入近6亿元，开发市场化技术1000余项，实现产品和服务收入近15亿元。建成国家级国际科技合作基地、国家技术转移示范机构和自动化与信息技术公共服务平台，市级以上研发与服务平台26个，已发展成为涵盖工业、信息化、生物医药、生态环保等重要领域的技术创新和产业化成果输出源。市科研院事企并存的 一院两制 管理运行模式和 三级 科研与开发服务体系受到国内外相关单位高度关注。在院所综合改革和成果转化的体制创新以及科技服务上，得到中央国家部委和省市等领导肯定。市委陈敏尔书记2018年11月调研我院，对易智网等科技服务工作给予充分肯定，给我院巨大鼓舞。
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